根據上述職責，玉林市商務局設7個科。

擬訂局工作制度；負責局機關行政事務管理，協(xié)調局內設機構工作；督辦重要工作事項；負責文電、秘書事務、機要保密、檔案管理；起草綜合性文件；承辦有關會議和接待活動；辦理因公出國組團、邀請外商來訪審批事項；負責電子政務、辦公室自動化、商務網站的管理；負責青工、婦女和老干部等工作；聯(lián)系協(xié)調扶貧、計劃生育；安全保衛(wèi)；來信來訪等。

負責局機關、事業(yè)單位人員編制，局管干部及下屬單位人員人事管理和教育培訓、人才培養(yǎng)、考核選拔；局管出國人員審查及駐外派出干部的選拔派出管理；局專業(yè)人員管理和實施專業(yè)資格制度；局屬院（校）、社會團體的管理。

負責對外宣傳、政務信息；負責商務局行政復議、行政訴訟等法律事務及機關普法工作。

指導并協(xié)調有關部門和相關中介機構開展產業(yè)安全方面工作及相關的宣傳、咨詢和培訓。

貫徹執(zhí)行國家有關關稅、外匯、稅收、信貸、價格等政策并就貫徹執(zhí)行中遇到的問題提出建議意見；負責管理勞動工資和局機關行政經費；管理各項內外貿發(fā)展基金、專項基金、基建投資等；負責局屬國有資產管理、內部審計監(jiān)督和局屬單位責任人經濟責任審計；指導局屬單位財務會計工作。

貫徹執(zhí)行國家、自治區(qū)進出口貿易管理細則；負責編制玉林市外貿發(fā)展計劃并指導實施；負責玉林市外貿宏觀運行狀況的預測、監(jiān)測、分析，對運行中出現的重大問題提出建議措施，負責匯總玉林市外貿統(tǒng)計及其信息發(fā)布工作；指導邊境貿易、東盟、港澳臺經貿等工作，并對進出口商品配額、關稅配額進行管理；貫徹執(zhí)行國家、自治區(qū)進出口商品配額招標政策；擬訂全市對外貿易發(fā)展計劃；指導協(xié)調外貿促進體系建設；管理、指導及組織境內外進出口商品交易會（包括洽談會、展銷會、商品博覽會等）；負責對外貿易經營者備案登記的上報工作；協(xié)助辦理國家實行國營貿易管理的貨物和經授權經營企業(yè)目錄的相關工作，負責國際貨運代理企業(yè)資格證書的審核上報；負責境外機構、企業(yè)常駐玉林市商務代表機構的核準業(yè)務；負責資源性產品出口供貨企業(yè)資格的審核；負責進出口經營秩序的協(xié)調管理，協(xié)調指導外貿信用體系建設；協(xié)調執(zhí)行國家進出口許可證管理制度。

支持協(xié)調企業(yè)對反傾銷、反補貼、保障措施的應訴；建立和完善進出口預警機制及產業(yè)損害預警機制。

貫徹執(zhí)行國家、自治區(qū)加工貿易政策，擬訂玉林市加工貿易規(guī)劃；負責玉林市加工貿易業(yè)務的管理、促進工作；研究玉林市加工貿易行業(yè)布局，協(xié)調解決加工貿易行業(yè)中存在的問題；指導協(xié)調出品加工區(qū)的管理工作。

負責對外承包工程、勞務合作和境外投資（金融類除外）、接受國際無償援助的管理以及擬訂業(yè)務發(fā)展規(guī)劃和業(yè)務管理辦法；負責玉林市企業(yè)對外投資設立企業(yè)的審核或申報工作；負責業(yè)務統(tǒng)計、外援項目實施情況的檢查和匯報工作。

貫徹執(zhí)行國家機電產品進出口政策、發(fā)展規(guī)劃和年度指導性計劃，組織機電產品開拓國際市場。協(xié)助管理國家限制出口技術和引進技術的出口與復出口工作。

貫徹執(zhí)行國家、自治區(qū)內貿發(fā)展戰(zhàn)略、行業(yè)規(guī)劃、流通產業(yè)等政策、法規(guī)；擬訂玉林市內貿發(fā)展計劃；執(zhí)行健全、規(guī)范市場體系的法規(guī)、規(guī)章及標準和實施細則；促進誠信體系建設；協(xié)調打破市場壟斷、行業(yè)壟斷和地區(qū)封鎖的有關工作，促進內外貿易結合，建立健全、統(tǒng)一、開放、競爭、有序的現代市場體系；協(xié)調有關部門擬訂市場體系建設總體規(guī)劃；指導城市商業(yè)網點規(guī)劃；協(xié)助培育和發(fā)展農村市場；指導大宗產品批發(fā)市場的流通服務和市場建設；引導國內外資金投向市場體系建設。規(guī)范商業(yè)領域投資的準入程序；負責拍賣、典當、租賃、舊貨流通等特殊流通行業(yè)市場準入審核并實行監(jiān)督；執(zhí)行汽車流通服務政策，規(guī)范汽車市場秩序。

推行連鎖經營、物流配送、電子商務等現代流通方式發(fā)展規(guī)劃；推廣先進流通技術；負責餐飲業(yè)、住宿業(yè)的行業(yè)管理；按規(guī)定對成品油流通進行監(jiān)督管理。

負責編制玉林市國內貿易發(fā)展計劃并指導實施；監(jiān)測分析、預測、統(tǒng)計市場運行和重要商品供求狀況；研究市場運行和調控方面的政策，并提出建議意見、協(xié)調解決運行中有關重大問題；負責實施重要消費品市場調控和市場信息咨詢；負責畜禽屠宰、酒類流通的監(jiān)督管理工作；負責繭絲綢在流通領域的監(jiān)督管理，協(xié)調行業(yè)發(fā)展，組織開拓國內外市場；負責匯總玉林市國內貿易統(tǒng)計及信息發(fā)布工作；負責提出深化商業(yè)企業(yè)流通體制改革的意見及建議，指導、監(jiān)督、協(xié)調商業(yè)企業(yè)的改革發(fā)展。

貫徹執(zhí)行國家和自治區(qū)對外開放及利用外資政策、法規(guī)；按規(guī)定負責核準外商投資企業(yè)的設立和變更；負責考核確認外商投資二類企業(yè)和鼓勵類項目的上報工作；負責編報國家實行配額許可證管理的外商投資企業(yè)進出口商品年度計劃并組織實施；負責國家規(guī)定的外商投資企業(yè)進口物資的審核管理工作；負責玉林市直接利用外資的統(tǒng)計、外商投資企業(yè)聯(lián)合年檢工作；負責外商投資企業(yè)人員的出入境的審核工作。